此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见HTSFilter。
Bioconductor版本:3.7
该包实现了基于全局Jaccard相似指数的复制转录组测序数据的过滤程序,以便在一个或多个实验条件下识别具有低、恒定表达水平的基因。
作者:Andrea Rau, Melina Gallopin, Gilles Celeux, Florence Jaffrezic
维护者:Andrea Rau < Andrea。劳在inra.fr >
引文(从R中输入引用(“HTSFilter”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HTSFilter”)
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HTSFilter”)
R脚本 | HTSFilter装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.12 (R-3.0)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.4) |
进口 | 刨边机(> = 3.9.14),DESeq2(> = 1.10.1),DESeq(> = 1.22.1),BiocParallel(> = 3),Biobase, utils, stats, grDevices, graphics, methods |
链接 | |
建议 | EDASeq(> = 2.1.4),BiocStyle,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | coseq |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | HTSFilter_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | HTSFilter_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | HTSFilter_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTSFilter |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HTSFilter |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HTSFilter/ |
包下载报告 | 下载数据 |