GreyListChIP

DOI:10.18129 / B9.bioc.GreyListChIP

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GreyListChIP。

灰名单——面具加工品地区基于芯片的输入

Bioconductor版本:3.7

识别区域的芯片实验的高信号输入,导致虚假的峰值在高峰。消除这些区域读取调整峰打电话之前,对清洁芯片分析。

作者:Gord布朗< gdbzork gmail.com >

维护人员:英国首相戈登•布朗(Gordon Brown) <戈登。布朗在cruk.cam.ac.uk >

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细节

biocViews	对齐,ChIPSeq,报道,DifferentialPeakCalling,GenomeAnnotation,预处理,测序,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.5),方法,GenomicRanges
进口	GenomicAlignments,BSgenome,Rsamtools,rtracklayer,质量平行,GenomeInfoDb,SummarizedExperiment统计,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,BiocGenerics,RUnit
SystemRequirements
增强了	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
URL
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GreyListChIP_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	GreyListChIP_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GreyListChIP_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GreyListChIP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GreyListChIP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GreyListChIP/
包下载报告	下载数据