GoogleGenomics.

DOI:10.18129 / b9.bioc.googlegenomics.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅GoogleGenomics.

R客户端用于Google Genomics API

生物导体版本:3.7

提供R包以与Google Genomics API交互。

作者:卡西娃娃,妮可Deflaux

维护者:Siddhartha Bagaria

引文(从R内,输入引文(“GoogleGenomics”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“GoogleGenomics”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“GoogleGenomics”)

HTML. r script. 注释变体
HTML. r script. 绘制对齐
HTML. r script. 再现变量注释结果
PDF. 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

Biocviews. DataImport.遗传学软件第三个龙客
版本 2.2.0
在生物导体中以来 BIOC 3.1(R-3.2)(3.5岁)
执照 Apache许可证(== 2.0)|文件许可证
依靠 r(> = 3.1.0),基因管理(> = 1.0.1),VariantAnnotation.
进口 生物仪器Genomeinfodb.Genomicranges.绞喉httr.rjson.RSAMTOOLS.S4Vectors.(> = 0.9.25),BioBase.,方法,utils
链接到
建议 生物焦Rprotobuf.http.knRAMAMAMDOW.testthat.GGBIO.ggplot2.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.org.hs.eg.db.txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.
系统要求 GNU制作
加强
URL. https://cloud.google.com/genomics/
Bugreports. https://github.com/biocodicabon/googlegenomics/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 googlegenomics_2.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件 googlegenomics_2.2.0.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.11(El Capitan) googlegenomics_2.2.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/googlegenomics.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/ GoogleGenomics
包短网址 http://biocidodder.org/packages/googlegenomics/
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生物体

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支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网