此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅GoogleGenomics.。
生物导体版本:3.7
提供R包以与Google Genomics API交互。
作者:卡西娃娃,妮可Deflaux
维护者:Siddhartha Bagaria
引文(从R内,输入引文(“GoogleGenomics”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“GoogleGenomics”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“GoogleGenomics”)
HTML. | r script. | 注释变体 |
HTML. | r script. | 绘制对齐 |
HTML. | r script. | 再现变量注释结果 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
Biocviews. | DataImport.那遗传学那软件那第三个龙客 |
版本 | 2.2.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.1(R-3.2)(3.5岁) |
执照 | Apache许可证(== 2.0)|文件许可证 |
依靠 | r(> = 3.1.0),基因管理(> = 1.0.1),VariantAnnotation. |
进口 | 生物仪器那Genomeinfodb.那Genomicranges.那绞喉那httr.那rjson.那RSAMTOOLS.那S4Vectors.(> = 0.9.25),BioBase.,方法,utils |
链接到 | |
建议 | 生物焦那Rprotobuf.那http.那kn那RAMAMAMDOW.那testthat.那GGBIO.那ggplot2.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.那org.hs.eg.db.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene. |
系统要求 | GNU制作 |
加强 | |
URL. | https://cloud.google.com/genomics/ |
Bugreports. | https://github.com/biocodicabon/googlegenomics/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | googlegenomics_2.2.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | googlegenomics_2.2.0.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | googlegenomics_2.2.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/googlegenomics. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/ GoogleGenomics |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/googlegenomics/ |
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