GeneRegionScan

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneRegionScan

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneRegionScan。

GeneRegionScan

Bioconductor版本:3.7

一个包与重点分析的离散区域的基因组。这个包是用于一个或几个基因的调查使用Affymetrix数据,因为它将使用Affymetrix电动工具提取探测器级数据应用和包装ProbeLevelSet这些数据。expressionSet ProbeLevelSet直接扩展,但包括额外的信息每个探针和探针的序列来自。包包含许多功能用于绘制这些探测水平数据沿着mRNA-strands序列位置的函数。可变剪接,这可以用于分析,尤其适合使用exon-array数据。

作者:Lasse Folkersen,迭戈Diez

维护人员:Lasse Folkersen < lasfol在cbs.dtu.dk >

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PDF	R脚本	GeneRegionScan
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,微阵列,OneChannel,单核苷酸多态性,软件,可视化
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(9.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	方法,Biobase(> = 2.5.5),Biostrings
进口	S4Vectors(> = 0.9.25),Biobase(> = 2.5.5),affxparser,RColorBrewer,Biostrings
链接
建议	BSgenome,affy,AnnotationDbi
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GeneRegionScan_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	GeneRegionScan_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GeneRegionScan_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneRegionScan
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneRegionScan
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GeneRegionScan/
包下载报告	下载数据