GeneGeneInteR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneGeneInteR

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneGeneInteR

工具测试基因基因在基因层面的交流

Bioconductor版本:3.7

这个包的目的是提出几种方法病例对照关联研究的基因基因交互测试。这种测试可以通过聚合SNP-SNP SNP级别的交互测试执行(SSI)或通过使用基因基因multidimensionnal方法(GGI)方法。包还提出了工具的图形显示结果。

作者:马修艾米丽,尼古拉•Sounac Florian Kroell, Magalie Houee-Bigot

维护人员:马修艾米丽<马修。艾米丽在agrocampus-ouest.fr >, Magalie Houee-Bigot < Magalie。在agrocampus-ouest.fr houee >

从内部引用(R,回车引用(“GeneGeneInteR”)):

安装

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PDF R脚本 GeneGeneInteR介绍
PDF R脚本 两两交互测试
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneticVariability,遗传学,GenomeWideAssociation,单核苷酸多态性,软件
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(2年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.3)
进口 snpStats,mvtnorm,GGtools,Rsamtools,igraph,kernlab,FactoMineR,plspm,IRanges,GenomicRanges,data.table,里奥哈葡萄酒、grDevices图形、属性、跑龙套
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GeneGeneInteR_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 GeneGeneInteR_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) GeneGeneInteR_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneGeneInteR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneGeneInteR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneGeneInteR/
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