Gwastools.

DOI:10.18129 / b9.bioc.gwastools.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Gwastools.

基因组宽协会研究的工具

生物导体版本:3.7

用于存储非常大的GWAS数据集和注释的类,以及GWAS数据清理和分析的功能。

作者:斯蒂芬妮M.Gogarten,塔里安·布兰塔尔,马修·劳雷斯,迈克尔·劳伦斯,迈克尔·劳伦斯,迈克林···普鲁格,伊恩画家,秀文郑,杰斯沉,罗希特·斯帕克尔,阿德里安斯·斯蒂普,萨拉·纳尔逊

维护者:斯蒂芬妮M.Gogarten ,Adrienne Stilp

引文(从R内,输入引文(“Gwastools”)):

安装

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##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“gwastools”)

文件

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Browsevignettes(“Gwastools”)

PDF. r script. Gwastools中的数据格式
PDF. r script. GWAS数据清洁
PDF. r script. 准备Affymetrix数据
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 遗传性微阵列QualityControl.SNP.软件
版本 1.26.1.
在生物导体中以来 BIOC 2.9(R-2.14)(7年)
执照 艺术-2.0
依靠 BioBase.
进口 图形,统计数据,Utils,方法,GDSFMT.DBI.rsqlite.gwasexacthwdnacopy.生存三明治lmtest.Logistf.QuantsMooth.
链接到
建议 NCDF4gwasdata.生物根系运行生物仪器Genomicranges.绞喉snprelate.Snpstats.S4Vectors.VariantAnnotation.
系统要求
加强
URL.
取决于我 gwasdata.
进口我 创世纪
建议我 Podkat.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 gwastools_1.26.1.tar.gz.
Windows二进制文件 gwastools_1.26.1.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) gwastools_1.26.1.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/gwastools.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包装/ gwastools
包短网址 http://biocidodder.org/packages/gwastools/
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