GSVA
doi：10.18129/b9.bioc.gsva
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅GSVA。
微阵列和RNA-seq数据的基因集变异分析
生物导体版本：3.7
基因集变异分析（GSVA）是一种非参数，无监督的方法，用于通过表达数据集的样品估计基因集富集的变化。GSVA对坐标系进行了更改，将数据从样品矩阵通过样品矩阵转换为基因集，从而允许评估每个样品的途径富集。GSVA富集的新矩阵得分有助于采用标准分析方法，例如功能富集，生存分析，聚类，CNV-Pathway分析或以途径为中心的方式进行跨组织分析。
作者：贾斯汀·吉尼（Justin Guinney）[AUT，CRE]，Robert Castelo [AUT]，Joan Fernandez [CTB]
维护者：贾斯汀·吉尼（Justin Guinney）
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| R脚本 | 基因集变异分析 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基因烯，，，，微阵列，，，，途径，，，，软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.8（R-2.13）（7。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 3.0.0） |
| 进口 | 方法，生物基因，，，，生物酶，，，，gseabase（> = 1.17.4），Geneplotter，，，，闪亮的，，，，有光泽的人 |
| 链接 | |
| 建议 | 林玛，，，，rcolorbrewer，，，，GeneFilter，，，，mclust，，，，EDGER，，，，雪， 平行，GSVADATA |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/rcastelo/gsva |
| BugReports | https://github.com/rcastelo/gsva/issues |
| 取决于我 | Sispa |
| 进口我 | 共识，，，，Egsea，，，，OPPAR，，，，Singlecelltk |
| 建议我 | McBiclust |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | gsva_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gsva_1.28.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | GSVA_1.28.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gsva |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/gsva |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gsva/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
