GSReg

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSReg

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见GSReg

基因集调控(GS-Reg)

Bioconductor版本:3.7

一种基于表达可变性的基因集分析包以及一种检测替代剪接事件的方法。它实现了差分秩守恒(DIRAC)和基因集表达变异分析(EVA)方法。为检测差异剪接基因,提供了一种剪接eva (splicing - eva, SEVA)的实现。

作者:Bahman Afsari < Bahman at jhu.edu>, Elana J. Fertig

维护者:Bahman Afsari < Bahman at jhu.edu>, Elana J. Fertig

引文(从R内,输入引用(“GSReg”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSReg”)

文档

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browseVignettes(“GSReg”)

PDF R脚本 使用GSReg包
PDF 参考手册

细节

biocViews AlternativeSplicingGeneExpressionGeneRegulationGeneSetEnrichmentGeneticVariability通路软件
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(四年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.13.1),Homo.sapiensorg.Hs.eg.dbGenomicFeaturesAnnotationDbi
进口
链接
建议 GenomicRangesGSBenchMark
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GSReg_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 GSReg_1.14.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) GSReg_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSReg
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSReg
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GSReg/
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