GSEABENCHMARKER

doi：10.18129/b9.bioc.gseabenchmarker

该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅GSEABENCHMARKER。

可再现的GSEA基准测试

生物导体版本：3.7

GSEABENCHMARKER软件包实现了可再现的框架，用于对基于集合和网络的方法的可再现评估，用于富集基因表达数据。这包括使用标准工作站和机构计算机网格的并行计算，对这些方法有效执行的有效执行。然后，可以评估方法对所研究表型的运行时，统计显着性以及结果的相关性。

作者：路德维希·盖斯特林格[AUT，CRE]，Gergely Csaba [aut]，Mara Santarelli [CTB]，Lucas Schiffer [CTB]，Marcel Ramos [CTB]，Ralf Zimmer [aut]，Levi Waldron [aut] [aut]

维护者：sph.cuny.edu>的路德维格·盖斯林格（Ludwig Geistlinger）

安装

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文档

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html	R脚本	可再现的GSEA基准测试
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，途径，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，软件，，，，可视化
版本	1.0.0
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5.0），生物酶，，，，总结性特征
进口	AnnotationDbi，，，，AnnotationHub，，，，Biocfilecache，，，，生物比较，，，，EDGER，，，，富集兄弟，，，，实验室，，，，地球，grdevices，图形，keggandmetacoredzpathwaysgeo，，，，keggdzpathwaysgeo， 方法，Rappdirs，，，，S4VECTORS，统计，utils
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/waldronlab/gseabenchmarker
BugReports	https://github.com/waldronlab/gseabenchmarker/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包装档案

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源包	gseabenchmarker_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	gseabenchmarker_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	gseabenchmarker_1.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gseabenchmarker
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/gseabenchmarker
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/gseabenchmarker/
软件包下载报告	下载统计