GOsummaries

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOsummaries

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOsummaries

GO富集分析的词云总结

Bioconductor版本:3.7

一个用于可视化基因本体论(GO)富集分析结果的包,这些结果来自不同的分析,如聚类或PCA。重要的GO类别被可视化为词云,可以与总结底层数据的不同图相结合。

作者:Raivo Kolde < Raivo。Kolde在eestie .ee>

维护者:Raivo Kolde < Raivo。Kolde在eestie .ee>

引用(从R中,输入引用(“GOsummaries”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite(" gosummarite ")

文档

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browseVignettes(“GOsummaries”)

PDF R脚本 GOsummaries基础知识
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类GeneExpression软件可视化
版本 2.16.1
在Bioconductor公司 BioC 3.0 (R-3.1)(四年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.15),Rcpp
进口 plyr、网格gProfileRreshape2limmaggplot2gtable
链接 Rcpp
建议 素食主义者
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/raivokolde/GOsummaries
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 GOsummaries_2.16.1.tar.gz
Windows二进制 GOsummaries_2.16.1.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) GOsummaries_2.16.1.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/GOsummaries
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ go撮要
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOsummaries/
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