FunChIP

DOI:10.18129 / B9.bioc.FunChIP

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见FunChIP．

基于形状的ChIP-Seq峰的聚类和对齐

Bioconductor版本:3.7

对ChIP-Seq峰值进行预处理和平滑，并有效实现k-mean对齐算法对其进行分类。

作者:Alice Parodi [aut, cre]， Marco Morelli [aut, cre]， Laura M. Sangalli [aut]， Piercesare Secchi [aut]， Simone Vantini [aut]

维护者:Alice Parodi

安装

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文档

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PDF	R脚本	FunChIP简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，聚类，软件，StatisticalMethod
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.2)，GenomicRanges
进口	闪亮的，食品及药物管理局，doParallel，GenomicAlignments，Rcpp、方法、foreach平行,GenomeInfoDb，Rsamtools， grDevices，图形，统计，RColorBrewer
链接	Rcpp
建议
SystemRequirements
增强了
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全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	FunChIP_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	FunChIP_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	FunChIP_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FunChIP
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FunChIP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FunChIP/
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