此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见DelayedMatrixStats.
Bioconductor版本:3.7
'matrixStats' API的一个端口,用于使用'DelayedArray'包中的DelayedMatrix对象。在DelayedMatrix对象的行和列上操作的高性能函数,例如col / rowMedians(), col / rowRanks()和col / rowSds()。针对每个数据类型和子集计算优化的函数,从而使内存使用和处理时间最小化。
作者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>
维护者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“DelayedMatrixStats”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DelayedMatrixStats”)
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browseVignettes(“DelayedMatrixStats”)
超文本标记语言 | R脚本 | DelayedMatrixStats概述 |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | DataRepresentation,基础设施,软件 |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | MIT +文件许可 |
取决于 | DelayedArray(> = 0.5.27) |
进口 | 方法,matrixStats(> = 0.53.1),矩阵,S4Vectors(> = 0.17.5),IRanges |
链接 | |
建议 | testthat,HDF5Array(> = 1.7.10),knitr,rmarkdown,covr,BiocStyle,微基准测试,profmem |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats |
BugReports | https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats/issues |
全靠我 | |
进口我 | bsseq,dmrseq,minfi,嘘,食物 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DelayedMatrixStats_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | DelayedMatrixStats_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | DelayedMatrixStats_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedMatrixStats |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DelayedMatrixStats |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DelayedMatrixStats/ |
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