DNAshapeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNAshapeR

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见DNAshapeR

DNA形状特征的高通量预测

Bioconductor版本:3.7

DNAhapeR是一个R/BioConductor包,用于超快速、高通量的DNA形状特征预测。该软件包允许预测,可视化和编码DNA形状特征进行统计学习。

作者:Tsu-Pei Chiu和Federico Comoglio

维护人员:Tsu-Pei Chiu

引文(从R内,输入引用(“DNAshapeR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DNAshapeR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DNAshapeR”)

超文本标记语言 R脚本 DNAshapeR
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNA3DStructure软件StructuralPrediction
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.4),GenomicRanges
进口 Rcpp(> = 0.12.1),Biostrings字段
链接 Rcpp
建议 AnnotationHubknitrrmarkdowntestthatBSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19脱字符号
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 DNAshapeR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 DNAshapeR_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) DNAshapeR_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAshapeR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DNAshapeR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DNAshapeR/
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