DNAcopy

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNAcopy

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见DNAcopy．

DNA拷贝数数据分析

Bioconductor版本:3.7

采用循环二进制分割(CBS)算法对DNA拷贝数数据进行分割，识别拷贝数异常的基因组区域。

作者:Venkatraman E. Seshan, Adam Olshen

维护者:Venkatraman E. Seshan

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DNAcopy”)

文档

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browseVignettes(“DNAcopy”)

PDF	R脚本	DNAcopy
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，软件
版本	1.54.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	CGHcall，cghMCR，单克隆，CRImage，PureCN，snapCGH
进口我	ADaCGH2，AneuFinder，ArrayTV，冠军，cn.farms，CNAnorm，CNVrd2，contiBAIT，conumee，文案，GWASTools，联合化疗，MEDIPS，MinimumDistance，QDNAseq，rCGH，Repitools，snapCGH
建议我	beadarraySNP，cn.mops，fastseg，genoset
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DNAcopy_1.54.0.tar.gz
Windows二进制	DNAcopy_1.54.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DNAcopy_1.54.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAcopy
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DNAcopy
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DNAcopy/
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