该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅dmchmm。
生物导体版本:3.7
DMCHMM是一种新型的分析工具,用于使用Bisulfite测序数据中隐藏的Markov模型鉴定差异甲基化的CpG位点。
作者:Farhad Shokoohi
维护者:farhad shokoohi
引用(从r内,输入引用(“ dmchmm”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ dmchmm”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ dmchmm”)
html | R脚本 | dmchmm |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,差甲基化,,,,HiddenMarkovModel,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.2.0 |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.4.0),总结性特征, 方法,S4VECTORS,,,,生物比较,,,,基因组机,,,,iranges,,,,fdrtool |
进口 | UTIT,统计,Grdevices,rtracklayer,,,,多comp,,,,校准,图形 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/shokoohi/dmchmm/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dmchmm_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | dmchmm_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | dmchmm_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dmchmm |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dmchmm |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dmchmm/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |