DESeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.DESeq

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见DESeq．

基于负二项分布的差异基因表达分析

Bioconductor版本:3.7

基于使用负二项分布的模型，估计来自高通量测序测定的计数数据中的方差-均值依赖性，并检验差异表达

作者:Simon Anders, EMBL Heidelberg

维护者:Simon Anders

安装

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PDF	R脚本	使用“DESeq”软件包分析RNA-Seq数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialExpression，RNASeq，圣人，测序，软件
版本	1.32.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(8.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	BiocGenerics(> = 0.7.5),Biobase(> = 2.21.7),locfit，晶格
进口	genefilter，geneplotter、方法、质量，RColorBrewer
链接
建议	pasilla(> = 0.2.10),vsn，gplots
SystemRequirements
增强了
URL	http://www-huber.embl.de/users/anders/DESeq
全靠我	DBChIP，埃达，metaseqR，Polyfit，SeqGSEA，移行细胞癌，tRanslatome
进口我	ampliQueso，ArrayExpressHTS，DEsubs，easyRNASeq，EDASeq，埃达，gCMAP，HTSFilter，rnaSeqMap，火神
建议我	BitSeq，compcodeR，dexus，DiffBind，肘，计，genefilter，IHWpaper，适当的，regionReport，SSPA，XBSeq
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DESeq_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	DESeq_1.32.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DESeq_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DESeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DESeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DESeq/
软件包下载报告	下载数据