DEScan2

DOI:10.18129 / B9.bioc.DEScan2

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见DEScan2．

差异富集扫描2

Bioconductor版本:3.7

集成峰值和差分呼叫，专为广泛的表观基因组信号设计。

作者:Dario Righelli, John Koberstein, Bruce Gomes, Nancy Zhang, Claudia Angelini, Lucia Peixoto, Davide Risso

维护者:Dario Righelli < Dario。在gmail.com righelli >

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DEScan2”)

文档

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超文本标记语言	R脚本	DEScan2装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，表观遗传学，PeakDetection，测序，软件
版本	1.0.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),GenomicRanges
进口	BiocGenerics，ChIPpeakAnno，data.table，DelayedArray，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，胶水，IRanges，plyr，Rcpp(> = 0.12.13),rtracklayer，S4Vectors，SummarizedExperiment、工具、跑龙套
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，刨边机，limma，EDASeq，RUVSeq，RColorBrewer，statmod
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	DEScan2_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	DEScan2_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DEScan2_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEScan2
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DEScan2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DEScan2/
包下载报告	下载数据