DChIPRep

DOI:10.18129 / B9.bioc.DChIPRep

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见DChIPRep．

分析染色质修饰ChIP-Seq数据与复制

Bioconductor版本:3.7

DChIPRep包实现了一种方法来评估复制ChIP-Seq研究中染色质修饰谱之间的差异，如Chabbert et. al . http://www.dx.doi.org/10.15252/msb.20145776所述。该方法的详细描述在https://doi.org/10.7717/peerj.1981的软件论文中给出

作者:Bernd Klaus [aut, cre]， Christophe Chabbert [aut]， Sebastian Gibb [ctb]

维护者:Bernd Klaus < Bernd。克劳斯在embl.de>

安装

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超文本标记语言	R脚本	DChIPRepVignette
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文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，测序，软件，WholeGenome
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(3年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4)，DESeq2
进口	方法，统计，效用，ggplot2，fdrtool，reshape2，GenomicRanges，SummarizedExperiment，smoothmest，plyr，tidyr，为了，S4Vectors，purrr，soGGi，ChIPpeakAnno
链接
建议	mgcv，testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
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全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

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源包	DChIPRep_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	DChIPRep_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DChIPRep_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DChIPRep
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DChIPRep
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DChIPRep/
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