ComplexHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ComplexHeatmap

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见ComplexHeatmap。

使复杂的热图

Bioconductor版本:3.7

复杂的热图可以有效地可视化不同数据源之间的关联，并揭示潜在的结构。这里，ComplexHeatmap包提供了一种高度灵活的方式来安排多个热图，并支持自定义注释图形。

作者:Zuguang顾

维护者:顾祖光

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ComplexHeatmap”)

文档

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browseVignettes(“ComplexHeatmap”)

超文本标记语言	R脚本	1.ComplexHeatmap包简介
超文本标记语言	R脚本	2.制作一张热图
超文本标记语言	R脚本	3.制作热图列表
超文本标记语言	R脚本	4.热图注释
超文本标记语言	R脚本	5.热图和注释图例
超文本标记语言	R脚本	6.热图装饰
超文本标记语言	R脚本	7.互动与热图
超文本标记语言	R脚本	8.OncoPrint
超文本标记语言	R脚本	9.更多的例子
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序,软件,可视化
版本	1.18.1
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(3.5年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R(>= 3.1.2)，方法，网格，图形，统计，grDevices
进口	circlize(> = 0.4.1),GetoptLong,色彩,RColorBrewer,GlobalOptions(> = 0.0.10)
链接
建议	testthat(> = 0.3),knitr,减价,集群,质量,pvclust,dendsort,HilbertCurve,开罗,png,jpeg,tiff,fastcluster,dendextend(> = 1.0.1)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmap
取决于我	EnrichedHeatmap,收回
进口我	BiocOncoTK,催化剂,cytofWorkflow,DEComplexDisease,DEGreport,部,diffcyt,埃尔默,EnrichmentBrowser,fCCAC,ImpulseDE2,LineagePulse,maftools,MWASTools,PathoStat,singleCellTK,TCGAbiolinks,TCGAWorkflow,YAPSA
建议我	gtrellis,HilbertCurve
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ComplexHeatmap_1.18.1.tar.gz
Windows二进制	ComplexHeatmap_1.18.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ComplexHeatmap_1.18.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ComplexHeatmap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ComplexHeatmap/
包下载报告	下载数据