ChIPexoQual

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPexoQual

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见ChIPexoQual．

ChIPexoQual

Bioconductor版本:3.7

封装与ChIP-exo/nexus数据的质量控制管道。

作者:Rene Welch, Dongjun Chung, Sunduz Keles

维护者:Rene Welch < Welch at stat.wisc.edu>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ChIPexoQual”)

文档

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超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
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文本		新闻

细节

biocViews	对齐，ChIPSeq，报道，质量控制，测序，软件，转录，可视化
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.4.0)，GenomicAlignments(> = 1.0.1)
进口	方法,跑龙套,GenomeInfoDb统计数据,BiocParallel，GenomicRanges(> = 1.14.4),ggplot2(> = 1.0),data.table(> = 1.9.6),Rsamtools(> = 1.16.1),IRanges(> = 1.6),S4Vectors(> = 0.8),biovizBase(> = 1.18),扫帚(> = 0.4),RColorBrewer(> = 1.1),dplyr(> = 0.5),尺度(> = 0.4.0),冬青(> = 0.3),hexbin(> = 1.27),rmarkdown
链接
建议	ChIPexoQualExample(> = 0.99.1),knitr(> = 1.10),BiocStyle，gridExtra(> = 2.2),testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https: github.com/keleslab/ChIPexoQual
BugReports	https://github.com/welch16/ChIPexoQual/issues
全靠我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ChIPexoQual_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	ChIPexoQual_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ChIPexoQual_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPexoQual
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChIPexoQual
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPexoQual/
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