ChIPComp

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPComp

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见ChIPComp。

多个ChIP-seq数据集的定量比较

Bioconductor版本:3.7

考虑匹配控制，ChIPComp可以在多种条件下检测差异结合的尖锐结合位点。

作者:吴昊，陈丽，秦朝晖，王驰

维护者:李晨<李。陈在emory.edu >

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ChIPComp”)

文档

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PDF	R脚本	ChIPComp
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,报道,DataImport,遗传学,MultipleComparison,测序,软件,转录
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(3年)
许可证	GPL
取决于	R (> = 3.2.0),GenomicRanges,IRanges,rtracklayer,GenomeInfoDb,S4Vectors
进口	Rsamtools,limma,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,BiocGenerics
链接
建议	BiocStyle,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ChIPComp_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ChIPComp_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ChIPComp_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPComp
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChIPComp
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPComp/
包下载报告	下载数据