别致的

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIC

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见别致的．

ChIP-Seq数据质量控制管道

Bioconductor版本:3.7

利用一套全面的质量控制指标，包括以前提出的指标，以及基于富集剖面的局部特征的新指标，对ChIP-seq数据进行质量控制管道。该框架允许评估具有明显或广泛富集剖面的样品质量，而以前提出的指标没有考虑到这一点。CHIC提供了质量控制指标和训练有素的机器学习模型的参考纲要，用于对样本进行评分。

作者:卡门·玛丽亚·利维

维护者:Carmen Maria Livi < Carmen。Livi在ifom.eu>

安装

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PDF	R脚本	别致的
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，质量控制，软件
版本	1.0.0
许可证	GPL-2
取决于	仕达屋优先计划， r (>= 3.5)
进口	ChIC.data(> = 0.99),caTools、方法、GenomicRanges，IRanges平行,脱字符号， grDevices，统计，utils，图形，S4Vectors，BiocGenerics
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包	ChIC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ChIC_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChIC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIC/
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