此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见CancerSubtypes.
Bioconductor版本:3.7
CancerSubtypes整合了目前常见的癌症亚型识别计算生物学方法,并提供了基于多组学数据(如基因表达、miRNA表达、DNA甲基化等)的癌症亚型分析的标准化框架。
作者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>,Thuc Le
维护者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>
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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CancerSubtypes”)
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browseVignettes(“CancerSubtypes”)
超文本标记语言 | R脚本 | CancerSubtypes |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,GeneExpression,软件,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(2年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.4),sigclust,NMF |
进口 | SNFtool,iCluster,集群,嫁祸于,limma,ConsensusClusterPlusgrDevices,生存 |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,RUnit,knitr,RTCGA.mRNA,RTCGA.clinical |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes |
BugReports | https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | CancerSubtypes_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | CancerSubtypes_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | CancerSubtypes_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CancerSubtypes |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CancerSubtypes/ |
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