CNVrd2

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNVrd2

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CNVrd2

CNVrd2:读地方法来检测和基因型复杂从下一代测序数据常见的拷贝数变异。

Bioconductor版本:3.7

CNVrd2使用新一代测序数据来衡量人类基因拷贝数为多个样品,鉴定snp标记的拷贝数变异和检测拷贝数多态基因区域。

作者:黄平君Tan阮,托尼R梅里曼和麦克指标黑色

维护人员:黄平君Tan Nguyen < hoangtannguyenvn gmail.com >

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PDF R脚本 与knitr减价插曲
PDF 参考手册

细节

biocViews 集群。,CopyNumberVariation,报道,LinkageDisequilibrium,单核苷酸多态性,测序,软件
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (r - 3.0)(5年)
许可证 GPL-2
取决于 R(> = 3.0.0)、方法VariantAnnotation平行,rjags,ggplot2,gridExtra
进口 DNAcopy,IRanges,Rsamtools
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/hoangtn/CNVrd2
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

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源包 CNVrd2_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 CNVrd2_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) CNVrd2_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNVrd2
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CNVrd2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CNVrd2/
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