CNPBayes

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNPBayes

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见CNPBayes．

拷贝数多态性的贝叶斯混合模型

Bioconductor版本:3.7

批效应和拷贝数的贝叶斯分层混合模型。

作者:斯蒂芬·克里斯蒂亚诺，罗伯特·沙尔夫，雅各布·凯里

维护者:Jacob Carey

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CNPBayes”)

文档

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PDF	R脚本	识别拷贝数多态性
PDF	R脚本	拷贝数估计的贝叶斯混合模型的实现
PDF	R脚本	CNPBayes包概述
PDF	R脚本	CNPBayes包概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯，CopyNumberVariation，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)，IRanges，GenomicRanges
进口	Rcpp(> = 0.12.1),S4Vectors，matrixStats，RColorBrewer，gtools，combinat，GenomeInfoDb(>= 1.11.6)，方法BiocGenerics，图形，统计，coda，SummarizedExperiment，mclust，reshape2，ggplot2，magrittr，purrr，tidyr，dplyr，宠物猫，尺度
链接	Rcpp
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，BiocCheck，质量
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/scristia/CNPBayes
BugReports	https://github.com/scristia/CNPBayes/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CNPBayes_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	CNPBayes_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CNPBayes_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNPBayes
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CNPBayes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CNPBayes/
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