CNORfeeder

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNORfeeder

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见CNORfeeder

集成CellNOptR以添加缺失的链接

Bioconductor版本:3.7

该软件包集成了文献约束和数据驱动的方法,从扰动实验推断信号网络。它允许扩展给定的网络,通过各种推断方法从数据中获得链接,并使用蛋白质物理相互作用的信息来指导和验证链接的整合。

作者:F.Eduati

维护者:F.Eduati

引文(从R内,输入引用(“CNORfeeder”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CNORfeeder”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CNORfeeder”)

PDF R脚本 主要插图:使用cnnorfeeder玩网络
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学CellBasedAssaysCellBiologyNetworkInference蛋白质组学软件
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(5.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.15.0),CellNOptR(> = 1.4.0),
进口
链接
建议 minetcatnetRgraphvizRUnitBiocGenericsigraph
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 CNORfeeder_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 CNORfeeder_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) CNORfeeder_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNORfeeder
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CNORfeeder
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CNORfeeder/
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Bioconductor

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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网