CNER
doi：10.18129/b9.bioc.cner
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅CNER。
CNE检测和可视化
生物导体版本：3.7
对保守非编码元素集的大规模识别和高级可视化。
作者：ge tan
维护者：ge tan
引用（从r内，输入引用（“ cner”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ CNER”）
| html | R脚本 | CNE识别和可视化 |
| html | R脚本 | 成对整个基因组比对 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，结肠管制，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.16.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（4。5年） |
| 执照 | GPL-2 |文件许可证 |
| 要看 | R（> = 3.4） |
| 进口 | 生物弦（> = 2.33.4），DBI（> = 0.7），rsqlite（> = 0.11.4），GenomeInfodB（> = 1.1.3），基因组机（> = 1.23.16），rtracklayer（> = 1.25.5），xvector（> = 0.5.4），基因组签名（> = 1.1.9），方法，S4VECTORS（> = 0.13.13），iranges（> = 2.5.27），readr（> = 0.2.2），生物基因，工具，并行，RESHAPE2（> = 1.4.1），GGPLOT2（> = 2.1.0），PowerLaw（> = 0.60.3），注释（> = 1.50.0），go.db（> = 3.3.0），r.utils（> = 2.3.0），keggrest（> = 1.14.0） |
| 链接 | S4VECTORS，，，，iranges，，，，xvector |
| 建议 | GVIZ（> = 1.7.4），生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER10，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，txdb.drerio.ucsc.danrer10.refgene，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.ggallus.ucsc.galgal3 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ge11232002/cner |
| BugReports | https://github.com/ge11232002/cner/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | TFBSTOOLS |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | cner_1.16.1.tar.gz |
| Windows二进制 | cner_1.16.1.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | cner_1.16.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cner |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/cner |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cner/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
