CGHCALL

doi:10.18129/b9.bioc.cghcall

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅CGHCALL

呼叫阵列CGH肿瘤轮廓的畸变。

生物导体版本:3.7

使用六个状态混合模型以及现有算法忽略的几种生物学概念来调用数组CGH数据的畸变。还提供了配置文件的可视化。

作者:马克·范·韦尔(Mark van de Wiel),Sjoerd Vosse

维护者:Mark van de Wiel

引用(从r内,输入引用(“ CGHCALL”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ cghcall”)

文档

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PDF R脚本 CGHCALL
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化
版本 2.42.0
在生物导体中 Bioc 2.1(R-2.6)(11年)
执照 GPL(http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html)
要看 r(> = 2.0.0),(> = 1.8.0),DNACOPIGY(> = 1.6.0),方法,生物酶,,,,CGHBASE(> = 1.15.1),降雪
进口
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 CGHNMALALALALITER,,,,焦点,,,,吉恩·布雷克(Genebreak)
进口我 CGHNMALALALALITER,,,,QDNASEQ
建议我 西加尔
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 CGHCALL_2.42.0.TAR.GZ
Windows二进制 CGHCALL_2.42.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) CGHCALL_2.42.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cghcall
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cghcall
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cghcall/
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