Bioqc.

DOI:10.18129 / b9.bioc.bioqc

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Bioqc.

用基因套检测表达谱中的组织异质性

生物导体版本:3.7

BioQC基于组织基因签名进行高通量表达数据的质量控制。它可以检测基因表达数据中的组织异质性。核心算法是一种用于高性能优化的Wilcoxon-Mann-Whitney测试。

作者:Jitao David Zhang ,Laura Badi,Gregor Sturm,Roland AMBS

维护者:jitao david zhang

引文(从R内,输入引文(“BioQC”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“BioQC”)

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BROWSEVIGNETTES(“BIOQC”)

HTML. r script. Bioqc alogrithm:加快Wilcoxon-Mann-Whitney测试
HTML. r script. Bioqc:检测基因表达数据中的组织异质性
HTML. r script. 使用BioQC与签名的基因
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 基因表达QualityControl.软件统计方法
版本 1.8.0.
在生物导体中以来 BIOC 3.3(R-3.3)(2.5岁)
执照 GPL(> = 3)
依靠 Utils,rcpp.BioBase.,方法,统计数据
进口
链接到
建议 testthat.knRAMAMAMDOW.格子latticeextra.rbenchmark.贡献格拉底hgu133plus2.db.Ineq.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
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建立报告

包档案包

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源包 bioqc_1.8.0.tar.gz.
Windows二进制文件 bioqc_1.8.0.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.11(El Capitan) bioqc_1.8.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/bioqc.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/ Bioqc
包短网址 http://biocidodder.org/packages/bioqc/
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