二乙衫

DOI：10.18129 / b9.bioc.bionet.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本，请参阅二乙衫。

生物网络功能分析的例程

生物导体版本：3.7

该包提供了蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的综合分析和功能模块的综合分析功能。可以通过将统计测试的P值分配给网络的节点来集成不同的数据集。例如。从亚胺阵列的基因的差异表达获得的p值被分配给网络的节点。通过拟合β均匀的混合物模型并从p值计算得分，可以计算网络区域的总分数，并且整数线性编程算法识别最大的评分子网络。

作者：Marcus Dittrich和Daniela Beisser

维护者：Marcus Dittrich

安装

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##如果不支持HTTPS：// URL，请尝试http：//源（“https://biocondudard.org/bioclite.r”）Bioclite（“Bionet”）

文件

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PDF.	r script.	双硫教程
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	DataImport.那不同的亚兴那基因表达那graphandnetwork.那微阵列那网络那NetworkenRichment.那软件
版本	1.40.0
在生物导体中以来	BIOC 2.7（R-2.12）（8年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 2.10.0），图形那RBGL.
进口	iGraph.（> = 1.0.1），annotationdbi.那BioBase.
链接到
建议	rgl.那赋予那DLBCL.那Genefilter.那xtable.那全部那林马那hgu95av2.db.那XML.
系统要求
加强
URL.	http:///bionet.bioApps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
取决于我
进口我	Htsanalyzer.那屏
建议我	圣诞节
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	Bionet_1.40.0.tar.gz.
Windows二进制文件	Bionet_1.40.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	bionet_1.40.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/bionet.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/二极管
包短网址	http://biocidodder.org/packages/bioneT/
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