BioCor

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioCor

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BioCor

功能相似

Bioconductor版本:3.7

计算功能的相似性基础上描述的通路KEGG和REACTOME或基因集。这些相似之处可以计算路径或基因集,基因,或集群和结合其他相似之处。他们可以用来改善网络,基因选择、测试的关系……

作者:Lluis里维拉桑丘< Lluis。里维拉在gmail.com >

维护人员:Lluis里维拉桑丘< Lluis。里维拉在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“BioCor”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“BioCor”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BioCor”)

HTML R脚本 关于BioCor
HTML R脚本 先进的使用BioCor
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 聚类,GeneExpression,网络,NetworkEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod,SystemsBiology
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(1.5年)
许可证 GPL-3 +文件许可
取决于 R (> = 3.4.0)
进口 BiocParallel,矩阵,GSEABase
链接
建议 reactome.db,org.Hs.eg.db,WGCNA、方法、GOSemSim,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,气道,DESeq2,引导,targetscan.Hs.eg.db,Hmisc
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/llrs/BioCor/
BugReports https://github.com/llrs/BioCor/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 BioCor_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 BioCor_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) BioCor_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioCor
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BioCor
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BioCor/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网