BayesPeak

DOI:10.18129 / B9.bioc.BayesPeak

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见BayesPeak

ChIP-seq数据的贝叶斯分析

Bioconductor版本:3.7

这个包是用于ChIP-seq数据中峰值调用的BayesPeak算法的实现。

作者:Christiana Spyrou, Jonathan Cairns, Rory Stark, Andy Lynch, Simon Tavar\\'{e},

维护者:Jonathan Cairns < Jonathan。凯恩斯在babraham.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“BayesPeak”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BayesPeak”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“BayesPeak”)

PDF R脚本 BayesPeak装饰图案
PDF 参考手册

细节

biocViews ChIPSeq软件
版本 1.32.0
在Bioconductor BioC 2.6 (R-2.11)(8.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.14),IRanges
进口 IRanges、图形
链接
建议 BiocStyle、并行
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 BayesPeak_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 BayesPeak_1.32.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) BayesPeak_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BayesPeak
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BayesPeak
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BayesPeak/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网