此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见BPRMeth.
Bioconductor版本:3.7
BPRMeth包是一种量化甲基化谱显式特征的概率方法,在某种程度上可以更容易地在下游建模工作中正式使用这些谱,例如预测基因表达水平或根据甲基化谱聚类基因组区域或细胞。
作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani [aut, cre]
维护者:Chantriolnt-Andreas Kapourani
引文(从R内,输入引用(“BPRMeth”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BPRMeth”)
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browseVignettes(“BPRMeth”)
超文本标记语言 | R脚本 | BPRMeth:模拟高阶甲基化剖面 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 贝叶斯,聚类,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FeatureExtraction,GeneExpression,GeneRegulation,遗传学,KEGG,RNASeq,回归,测序,SingleCell,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.4.0),GenomicRanges |
进口 | 为了、方法、质量,doParallel平行,e1071,地球,foreach,randomForest统计数据,IRanges,S4Vectors,data.table、图形、truncnorm,mvtnorm,Rcpp(> = 0.12.14),matrixcalc,magrittr,kernlab,ggplot2,cowplot,BiocStyle |
链接 | Rcpp,RcppArmadillo |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BPRMeth_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | BPRMeth_1.6.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | BPRMeth_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BPRMeth |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BPRMeth |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BPRMeth/ |
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