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AnnotationForge
DOI:10.18129 / B9.bioc.AnnotationForge
此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见AnnotationForge．
构建注释数据库包的代码
Bioconductor版本:3.7
提供用于生成注释包及其数据库的代码。生成的包旨在与AnnotationDbi一起使用。
作者:马克·卡尔森，Hervé Pagès
Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>
引文(从R中输入引用(“AnnotationForge”)）：
安装
要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“AnnotationForge”)
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“AnnotationForge”)
| R脚本 | AnnotationForge:为自定义注释资源创建选择接口 | |
| R脚本 | 创建探测包 | |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 制作新的有机体包装 |
| R脚本 | SQLForge:一种使用标准数据库模式创建新的注释包的简单方法。 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释，基础设施，软件 |
| 版本 | 1.22.2 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (R-2.15)(6年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(>= 2.7.0)，方法，utils，BiocGenerics(> = 0.15.10),Biobase(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.33.14) |
| 进口 | DBI，RSQLite，XML，S4Vectors，RCurl |
| 链接 | |
| 建议 | biomaRt，httr，GenomeInfoDb(> = 1.16.0),Biostrings，affy，hgu95av2.db，human.db0，org.Hs.eg.db，Homo.sapiens，hom.Hs.inp.db，GO.db，BiocStyle，knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | AnnotationHubData，GGHumanMethCancerPanelv1.db，GOstats |
| 建议我 | AnnotationDbi，AnnotationHub |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | AnnotationForge_1.22.2.tar.gz |
| Windows二进制 | AnnotationForge_1.22.1.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | AnnotationForge_1.22.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationForge |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AnnotationForge |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationForge/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
