该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅等位基因平衡。
生物导体版本:3.7
使用RNA-seq数据为等位基因表达研究提供了一个框架。
作者:Jesper R Gadin,Lasse Folkersen
维护者:jesper r gadin
引用(从r内,输入引用(“等位基因平衡”)
):
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R脚本 | 等位基因平衡小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 遗传学,,,,基础设施,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.2.0),网格,基因组机(> = 1.31.8),总结性特征(> = 0.2.0),基因组签名(> = 1.15.6) |
进口 | 方法,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,BSGENOME(> = 1.47.3),变体(> = 1.25.11),生物弦(> = 2.47.6),S4VECTORS(> = 0.17.25),iranges(> = 2.13.12),rsamtools(> = 1.31.2),GenomicFeatures(> = 1.31.3),GVIZ,,,,格子,,,,LatticeExtra,,,,栅格,,,,seqinr,,,,GenomeInfodB,,,,nlme |
链接 | |
建议 | 测试,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/pappewaio/allelicimbalance |
BugReports | https://github.com/pappewaio/allelicimbalance/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Allelicimbalance_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | AlleLicimbalance_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Allelicimbalance_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/allowricimbalance |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/等位基因影响 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/allelicimbalance/ |
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