此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见ASpli.
Bioconductor版本:3.7
使用RNAseq分析替代拼接的综合管道。
作者:Estefania Mancini, Javier Iserte, Marcelo Yanovsky和Ariel Chernomoretz
维护:Estefania Mancini
引文(从R内,输入引用(“ASpli”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ASpli”)
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browseVignettes(“ASpli”)
R脚本 | 基于ASpli的可选拼接分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GenomeAnnotation,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(2年) |
许可证 | GPL |
取决于 | 方法,grDevices, stats, utils, parallel,刨边机 |
进口 | GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocGenerics,IRanges,GenomicAlignments,Gviz,S4Vectors,AnnotationDbi,Rsamtools,BiocStyle |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ASpli_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | ASpli_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | ASpli_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASpli |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/ |
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