adacgh2

doi:10.18129/b9.bioc.adacgh2

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅adacgh2

使用并行计算和FF对象分析ACGH实验的大数据

生物导体版本:3.7

阵列CGH数据的分析和绘制。允许使用圆形二进制分离,基于小波的平滑度(如Liu等人,以及Ben-Yaacov和Eldar中的Haarseg),HMM,Biohmm,Glad,cghseg。大多数计算都是并行的(通过分叉或与群集,包括MPI和插座群集),并使用FF来存储数据。

作者:ramon diaz-uriarte 和oscar M. rueda 。fhcrc.org>的li hsu 上。来自Barry Rowlingson的ImageMap代码。来自Erez Ben-Yaacov的Haarseg代码;从下载。

维护者:ramon diaz-uriarte

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安装

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PDF R脚本 ADACGH2概述
PDF adacgh2长示例.pdf
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PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,微阵列,,,,软件
版本 2.20.0
在生物导体中 Bioc 2.7(R-2.12)(8年)
执照 GPL(> = 3)
要看 R(> = 3.2.0),并行,ff,,,,高兴的
进口 少量,,,,ffbase,,,,DNACOPIGY,,,,蒂格拉里,,,,挥手,,,,,,,,ACGH,,,,Snapcgh
链接
建议 cghrigions,,,,开罗,,,,林玛
系统要求
增强 rmpi
URL https://github.com/rdiaz02/adacgh2
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 adacgh2_2.20.0.tar.gz
Windows二进制 adacgh2_2.20.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) adacgh2_2.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adacgh2
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/adacgh2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/adacgh2/
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