adacgh2
doi：10.18129/b9.bioc.adacgh2
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅adacgh2。
使用并行计算和FF对象分析ACGH实验的大数据
生物导体版本：3.7
阵列CGH数据的分析和绘制。允许使用圆形二进制分离，基于小波的平滑度（如Liu等人，以及Ben-Yaacov和Eldar中的Haarseg），HMM，Biohmm，Glad，cghseg。大多数计算都是并行的（通过分叉或与群集，包括MPI和插座群集），并使用FF来存储数据。
作者：ramon diaz-uriarte
维护者：ramon diaz-uriarte
引用（从r内，输入引用（“ adacgh2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// URL不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ adacgh2”）
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ adacgh2”）
| R脚本 | ADACGH2概述 | |
| adacgh2长示例.pdf | ||
| Benchmarks.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，微阵列，，，，软件 |
| 版本 | 2.20.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.7（R-2.12）（8年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | R（> = 3.2.0），并行，ff，，，，高兴的 |
| 进口 | 少量，，，，ffbase，，，，DNACOPIGY，，，，蒂格拉里，，，，挥手，，，，簇，，，，ACGH，，，，Snapcgh |
| 链接 | |
| 建议 | cghrigions，，，，开罗，，，，林玛 |
| 系统要求 | |
| 增强 | rmpi |
| URL | https://github.com/rdiaz02/adacgh2 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | adacgh2_2.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | adacgh2_2.20.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | adacgh2_2.20.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adacgh2 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/adacgh2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/adacgh2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
