parathyroidSE

DOI:10.18129 / B9.bioc.parathyroidSE

Haglund等人对甲状旁腺肿瘤原代培养RNA-Seq的研究，《临床内分泌杂志》2012。

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包提供了来自甲状旁腺肿瘤原代培养实验的成对端RNA-Seq数据的基因和外显子部分的读取计数的rangedsummarizeexperiments对象。数据发表于Haglund F, Ma R, Huss M, Sulaiman L, Lu M, Nilsson IL, Hoog a, Juhlin CC, Hartman J, Larsson C, J clinin Endocrinol Metab的文章《甲状旁腺腺瘤中功能性雌激素受体的证据》。jc。2012-2484, Epub 2012年9月28日，midid: 23024189。在3种情况(DPN、OHT和对照组)的2个时间点对4例患者的肿瘤培养物进行测序。一个控制样本由于质量不高而被作者省略。包小插图描述了从NCBI基因表达Omnibus提供的原始测序数据创建对象，登录号为GSE37211。基因和外显子特征是GRCh37 Ensembl注释。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:Michael Love

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“parathyroidSE”)

文档

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browseVignettes(“parathyroidSE”)

PDF	R脚本	parathyroidGenesSE
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，RNASeqData，SequencingData
版本	1.16.0
许可证	LGPL
取决于	SummarizedExperiment， r (>= 2.10)
进口
链接
建议	Rsamtools，GenomicAlignments，GEOquery，SRAdb，GenomicFeatures，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	ClassifyR，DEXSeq，simulatorZ
构建报告

包档案

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源包	parathyroidSE_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/parathyroidSE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/parathyroidSE/
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