curatedMetagenomicData

DOI:10.18129 / B9.bioc.curatedMetagenomicData

人类微生物组的策划宏基因组数据

Bioconductor版本:版本(3.6)

curatedMetagenomicData包提供微生物分类、功能以及基因标记样本收集来自不同bodysites丰富。

作者:卢卡斯希弗<希弗。卢卡斯在gmail.com >,Edoardo Pasolli , Levi Waldron , Faizan Malik , Nicola Segata , Valerie Obenchain , Morgan Martin

维护人员:卢卡斯希弗<希弗。卢卡斯在gmail.com >

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文档

HTML R脚本 curatedMetagenomicData
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文本 新闻

细节

biocViews ExperimentData,Homo_sapiens_Data,MicrobiomeData,ReproducibleResearch
版本 1.8.1
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.4.0),dplyr(> = 0.5.0),Biobase(> = 2.37.0),ExperimentHub(1.3.0 > =版本),AnnotationHub(> = 2.9.0)
进口 跑龙套,tidyr,magrittr、方法、S4Vectors
链接
建议 BiocInstaller,devtools,roxygen2,testthat,covr,knitr,rmarkdown,BiocCheck,BiocStyle,BiocParallel,readr,RISmed,ggplot2,metagenomeSeq,phyloseq,
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/waldronlab/curatedMetagenomicData
BugReports https://github.com/waldronlab/curatedMetagenomicData/issues
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源包 curatedMetagenomicData_1.8.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/curatedMetagenomicData
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/curatedMetagenomicData/
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