RforProteomics

DOI:10.18129 / B9.bioc.RforProteomics

“使用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析”出版物的配套包

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包包含代码来说明“使用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析”论文。两个小插图描述了再现论文中描述的示例和图形以及蛋白质组学可视化功能所需的代码和数据。

作者:Laurent Gatto [aut, cre], Thomas Lin Pedersen [ctb], Sebastian Gibb [ctb], Vlad Petyuk [ctb]

维护者:Laurent Gatto

引文(从R内,输入引用(“RforProteomics”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RforProteomics”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RforProteomics”)

PDF R脚本 用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析的现状展望
PDF R脚本 RforProteomics Bioc2013海报
PDF R脚本 用R进行蛋白质组学数据分析
超文本标记语言 使用R和Bioconductor可视化蛋白质组学数据
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExperimentDataMassSpectrometryDataReproducibleResearch
版本 1.15.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 MSnbase
进口 R.utilsBiobaserpxbiocViewsBiocInstallerinteractiveDisplay闪亮的
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStylemzRxcmsmsdata等压线MALDIquant(> = 1.12),MALDIquantForeignreadBrukerFlexDatarTANDEMsynaptersynapterdataIPPDRdisopOrgMassSpecR大脑的方式hparGO.dborg.Hs.eg.dbbiomaRtRColorBrewerggplot2reshape2xtable晶格mzIDpRolocpRolocdataMSGFplusMSGFguiMSnIDmsmsTestsmsmsEDAcorrplotHeatplusgplots维恩图genefilter
SystemRequirements
增强了 切肉刀
URL http://lgatto.github.com/RforProteomics/
全靠我
进口我
建议我 MSstatsQCproteoQCqcmetrics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RforProteomics_1.15.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RforProteomics
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RforProteomics/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网