RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

对齐读取从RNAseq实验:高通量测序转录剖析的HNRNPC击倒和控制海拉细胞

Bioconductor版本:版本(3.6)

包包含8 BAM文件,1 /测序运行。每个BAM文件是通过(1)调整读取(paired-end)与TopHat2完整hg19基因组,然后(2)构造子集只保留chr14比对。看到加入数字e - mtab - 1147 ArrayExpress数据库中有关实验的细节,包括链接到发表的研究(Zarnack et al ., 2012)和FASTQ文件。

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安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ArrayExpress,ExperimentData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,NCI,RNASeqData,SequencingData
版本	0.16.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	GenomicAlignments,BiocInstaller
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/
取决于我	samExploreR
进口我
建议我	BiocParallel,GenomicAlignments,GenomicFiles,GenomicRanges,咆哮,Rsamtools,SplicingGraphs
构建报告

包档案

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源包	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/
包下载报告	下载数据