XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38

额外的SNP地点智人(dbSNP构建141)

Bioconductor版本:版本(3.6)

额外的SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP构建141。源数据文件用于这个包是由NCBI 5月1日,2014年,包含snp GRCh38映射到参考基因组。而SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141。GRCh38包只包含分子变化类“国民党”,这个包包含其他类的分子变化(named-locus (del、杂合的微卫星,缺乏变化,混合,和multinucleotide-polymorphism)。

作者:Herve页面

维修工:h .页< hpages fhcrc.org >

从内部引用(R,回车引用(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,XtraSNPlocs
版本 0.99.12
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10),S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome(> = 1.35.5)
进口 方法,跑龙套,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome
链接
建议 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38(> = 1.3.19)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网