# #——风格,呼应= FALSE,结果=“黑名单”,消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - BiocStyle::减价()# # - - - - - env,呼应= FALSE,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(Pbase) # #——pplot,呼应= FALSE, fig.width = 8.5, fig.height = 8.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Pbase::: pplot () # # - - - - - fa,缓存= TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(“Biostrings”) fafile < -执行(“extdata / HUMAN_2015_02_selected。fasta”,包= " Pbase”) fa <——readAAStringSet fafile fa # # - - - - - psm,缓存= TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(“mzID”) idfile < -执行(“extdata / Thermo_Hela_PRTC_selected。mzid”,包= " Pbase”) id < -平(mzid (idfile))的(id)头(id) # # - - - - - p,缓存= TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(“Pbase”) p < -蛋白质(fafile) p <——addIdentificationData p (p, idfile) # #——paccess - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aa (p) seqnames (p)撞击(p) pfeatures (p) # #元数据- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -元数据(p)埃珂叫牌法(p) pcols (p) # #——情节,fig.align =‘中心’,缓存= TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - seqnames (p)情节(p [c (9)]) # # si - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sessionInfo ()