doi:10.18129/b9.bioc.yarn

纱线:强大的多条件RNA-Seq预处理和归一化

生物导体版本:版本(3.6)

使用先前开发的工具组合加快大型RNA-SEQ分析。YARN旨在使用户更容易执行基本的错误保管质量控制,过滤和条件意识的归一化。纱线利用许多生物导体工具和统计技术来解释在非常大的RNA-Seq实验中发现的较大的异质性和稀疏性。

作者:Joseph N Paulson [AUT,CRE],Cho-Yi Chen [aut],Camila Lopes-Ramos [aut],Marieke Kuijjer [aut],John Platig [aut],Abhijeet Sonawane [aut],Maud Fagny [aut],Kimberly Glass [AUT],John Quackenbush [aut]

维护者:Joseph N Paulson

引用(从r内,输入引用(“纱”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ yarn”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“纱”)

PDF R脚本 纱线:强大的多组织RNA-seq预处理和归一化
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,聚类,,,,基因表达,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看 生物酶
进口 Biomart,,,,下载器,,,,EDGER,,,,GPLOTS,图形,林玛,,,,矩阵,,,,预处理,,,,readr,,,,rcolorbrewer,统计Quantro
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 0.8)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 yarn_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 yarn_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Yarn_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yarn
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/yarn/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网