方差分区

doi:10.18129/b9

量化和解释多级基因表达实验中变异的潜水

生物导体版本:版本(3.6)

量化和解释基因表达实验中生物学和技术变异的多种来源。使用线性混合模型来量化归因于个体,组织,时间点或技术变量的基因表达变异。

作者:加布里埃尔·霍夫曼(Gabriel E. Hoffman)

维护者:Gabriel E. Hoffman

引用(从r内,输入引用(“方差分区”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“差异分区”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“方差分配”)

PDF R脚本 1)有关使用方差分区的教程
PDF R脚本 2)其他可视化
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,rnaseq,,,,回归,,,,软件
版本 1.8.1
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(2。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 GGPLOT2,,,,foreach,,,,生物酶, 方法
进口 大量的,,,,pbkrtest(> = 0.4-4),迭代器,花键,柱面,,,,GPLOTS,,,,RESHAPE2,,,,LME4(> = 1.1-10),多帕尔,,,,林玛,grdevices,图形,utils,统计
链接
建议 EDGER,,,,Dendextend,,,,tximport,,,,tximportdata,,,,舞会礼服,,,,deseq2,,,,readr,,,,尼特,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 VariancePartition_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 VariancePartition_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) VariancePartition_1.8.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/variancepartition
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/variancepartition/
软件包下载报告 下载统计
Bioc 3.6的旧源软件包 来源存档

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网