三人组

DOI:10.18129 / B9.bioc.trio

检测单核苷酸多态性和SNP交互Case-Parent三人研究

Bioconductor版本:版本(3.6)

检测单核苷酸多态性和SNP基因型的交互的TDT。这个包此外包含函数计算成对值LD措施和确定LD街区,以及功能设置匹配情况下pseudo-control基因型数据case-parent三人小组为了运行三个逻辑回归,在三人小组将缺失的基因型,为模拟case-parent三人小组与疾病风险依赖SNP交互,对权力和样本量计算三个数据。

作者:Holger Schwender清丽,菲利普·伯杰,玛格丽特•陶布Christoph Neumann Ingo Ruczinski

维护人员:Holger Schwender < Holger。等在gmx.de >

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PDF	R脚本	三个逻辑回归和基因型的TDT
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,微阵列,单核苷酸多态性,软件
版本	3.16.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(4.5年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (> = 3.0.1)
进口
链接
建议	生存,haplo.stats,mcbiopi,siggenes样条函数,LogicReg(> = 1.5.3)更正,logicFS(> = 1.28.1),KernSmooth,VariantAnnotation
SystemRequirements
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包档案

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源包	trio_3.16.0.tar.gz
Windows二进制	trio_3.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	trio_3.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trio
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/trio/
包下载报告	下载数据