transcriptogramer

DOI:10.18129 / B9.bioc.transcriptogramer

基于转录图的转录分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

R包用于基于转录图的转录分析,这是一种分析转录组的方法,将表达值投射到一组有序蛋白质上,其排列方式是基因产物参与同一代谢途径的概率随着排序的两个蛋白质之间距离的增加而呈指数下降。因此,转录谱是全基因组的基因表达谱,为细胞代谢提供了一个全局视图,同时表明其表达被改变的基因集。

作者:Diego Morais [aut, cre], Rodrigo Dalmolin [aut]

维护者:Diego Morais

引文(从R内,输入引用(“transcriptogramer”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“转录记录仪”)

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超文本标记语言 R脚本 转录仪用户指南
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细节

biocViews GeneExpressionGeneSetEnrichmentGenomeWideAssociation网络软件SystemsBiology可视化
版本 1.0.0
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.4),方法
进口 biomaRtdata.tabledoSNOWforeach,图形,grDevices,igraphlimma平行,进步红色的统计数据,topGO
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdownRUnitBiocGenerics
SystemRequirements Java运行时环境(>= 6)
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包档案

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源包 transcriptogramer_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 transcriptogramer_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) transcriptogramer_1.0.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transcriptogramer
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/transcriptogramer/
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