trackViewer

DOI:10.18129 / B9.bioc.trackViewer

R / Bioconductor方案图纸优雅交互跟踪或棒棒糖阴谋促进multi-omics数据的综合分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

可视化映射读取连同注释作为门店的数据集,如ChIP-seq追踪层,RNA-seq, miRNA-seq DNA-seq、单核苷酸多态性和甲基化数据。

作者:Jianhong Ou,咏Wang丽华朱莉朱

维护人员:Jianhong Ou < Ou。jianhong gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“trackViewer”)

文档

HTML	R脚本	trackViewer装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	软件,可视化
版本	1.14.1
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(4年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.1.0), grDevices,方法,GenomicRanges、网格
进口	GenomeInfoDb,GenomicAlignments,GenomicFeatures,Gviz,pbapply,Rsamtools,rtracklayer,S4Vectors,尺度、工具、IRanges,AnnotationDbi,grImport,htmlwidgets
链接
建议	biomaRt,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,RUnit,org.Hs.eg.db,BiocGenerics,BiocStyle,knitr,VariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	彗星
进口我	NADfinder
建议我	ATACseqQC,ChIPpeakAnno
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	trackViewer_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	trackViewer_1.14.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	trackViewer_1.14.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trackViewer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/trackViewer/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档