spliceSites

DOI:10.18129 / B9.bioc.spliceSites

用于从RNA-seq数据中探索对齐间隙位置的生物导体包

Bioconductor版本:Release (3.6)

对RNA-seq数据进行剪接中心分析。

作者:沃尔夫冈·凯泽斯

维护者:Wolfgang Kaisers < Kaisers at med.uni-duesseldorf.de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“spliceSites”)

文档

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browseVignettes(“spliceSites”)

PDF	R脚本	spliceSites
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，蛋白质组学，RNAseq，软件
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	方法,rbamtools(> = 2.14.3),refGenome(> = 1.6.0),Biobase，Biostrings(> = 2.28.0)
进口	BiocGenerics，杜比环绕声系统，seqLogo，IRanges
链接
建议
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增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	spliceSites_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	spliceSites_1.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	spliceSites_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spliceSites
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/spliceSites/
软件包下载报告	下载数据