snapCGH

DOI:10.18129 / B9.bioc.snapCGH

aCGH数据的分割、归一化和处理。

Bioconductor版本:Release (3.6)

aCGH数据的分割、归一化和处理方法;包括用于单个和多个数组的原始和分段数据可视化的绘图函数。

作者:迈克·l·史密斯，约翰·c·马里奥尼，史蒂文·麦金尼，托马斯·哈德卡斯尔，娜塔莉·p·索恩

维护者:John Marioni < Marioni at uchicago.edu>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("snapCGH")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“snapCGH”)

PDF	R脚本	分割概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，预处理，软件，TwoChannel
版本	1.48.0
在Bioconductor公司	BioC 1.8 (R-2.3)(12年)
许可证	GPL
取决于	limma，DNAcopy、方法
进口	aCGH，集群，DNAcopy，很高兴，图形，grDevices，limma，方法，统计，tilingArray,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	ADaCGH2
建议我	beadarraySNP
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	snapCGH_1.48.0.tar.gz
Windows二进制	snapCGH_1.48.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	snapCGH_1.48.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/snapCGH
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/snapCGH/
软件包下载报告	下载数据